Fue fundador y primer presidente de la Comunidad Homosexual Argentina (CHA)
La CHA es una de las organizaciones, aunque no la única, más fuertes y representativas de los derechos de la comunidad LGBTQI y fue fundada por Jáuregui en abril del 1984. Carlos estuvo tres años al frente.
"Un 16 de abril de 1984 un grupo de casi un centenar de valientes había dicho basta y decidido reunirse para discutir qué hacer ante las detenciones que la policía federal realizaba en la calle y ante las razzias a los lugares de sociabilidad de homosexuales. Esas personas -muchos ni se conocían- eran radicales, peronistas, católicos, algunos vivían en Palermo, otros llegaban desde el conurbano, había trotskos, ex militantes del FLH, algunos anarquistas, estaban los que habían leído a Foucault y los que habían viajado fuera del país y traían otras perspectivas, estaban los que confiaban, los escépticos, los que pretendían reclamar pero sin hacer mucho lío, y los que pensaban que con discriminación y represión no había democracia", explica Pecoraro.
A los pocos días de la fundación de la CHA, Carlos hizo su primera aparición pública, identificándose como homosexual, en la portada de la revista Siete Días y, se convirtió, de esta manera, en la cara visible de la organización y de la comunidad.
Durante la la asamblea de fundación de la CHA, que se realizó en la discoteca Contramano, Carlos había sugerido que la agrupación se llamara Putos Unidos, pero no fue aprobada por la mayoría. En 1987 fue nombrado Secretario de DDHH de la CHA, cargo que ocupó pocos meses ya que rompió definitivamente con la organización y se dedicó de lleno a cuidar a su pareja Pablo Azcona que estaba muy grave por el VIH/Sida, quien finalmente falleció en 1988.
